Bioinformatyk (Starszy Specjalista) w Laboratorium Diagnostyki Genetycznej i Mikrobiologicznej (k/m)

Wykształcenie wyższe (magister lub doktor) w obszarze bioinformatyki, biologii obliczeniowej, biotechnologii, biologii molekularnej, informatyki lub kierunków pokrewnych;, Minimum 3 lat doświadczenia w analizie bio-danych wysokoprzepustowych, w szczególności danych genomowych (NGS);, Bardzo dobra znajomość metod analizy danych sekwencjonowania nowej generacji, w tym analiz WGS, WES, RNA-Seq, panelowych lub metagenomicznych z próbek klinicznych;, Doświadczenie w pracy w środowisku Linux/Unix oraz w obsłudze klastrów obliczeniowych lub środowisk HPC;, Doświadczenie w analizie jakości danych, walidacji pipeline’ów oraz interpretacji wyników biologicznych w kontekście klinicznym lub badawczym;, Biegłość w co najmniej jednym języku programowania stosowanym w bioinformatyce (Python, R, Bash), w tym umiejętność tworzenia i utrzymywania pipeline’ów analitycznych;, Praktyczna znajomość narzędzi i formatów bioinformatycznych (np. FASTQ, BAM/CRAM, VCF, GFF, BED; BWA, Bowtie2, GATK, samtools, bcftools, Nextflow/Snakemake);, Umiejętność pracy w środowisku regulowanym (system jakości, laboratorium BSL-2, ewidencjonowanie zapisów w ścieżkach procesów);, Samodzielność, skrupulatność, dbałość o szczegóły, rzetelność, odpowiedzialność za powierzony obszar oraz za realizowane usługi komercyjne i badawczo-rozwojowe;, Znajomość języka angielskiego na poziomie umożliwiającym swobodną komunikację w środowisku naukowym, klientami zagranicznymi oraz zdobywanie wiedzy z anglojęzycznej literatury fachowej., Doświadczenie w pracy w projektach genomiki populacyjnej, klinicznej lub diagnostycznej;, Doświadczenie we współpracy z zespołem laboratoryjnym (biotechnolodzy, mikrobiolodzy, diagności laboratoryjni), w tym umiejętność rozumienia procesów laboratoryjnych sekwencjonowania (NGS) oraz ich wpływu na etapy i wyniki analizy bioinformatycznej;, Znajomość zagadnień związanych z interpretacją wariantów patogenicznych (variant calling, annotation, klasyfikacja wariantów, bazy referencyjne);, Doświadczenie w analizach metagenomicznych, mikrobiologicznych lub epidemiologii molekularnej;, Znajomość algorytmów i narzędzi stosowanych w identyfikacji oraz screeningu funkcjonalnych peptydów (np. analiza sekwencji, predykcja aktywności biologicznej, stabilności lub oddziaływań);, Znajomość standardów jakościowych stosowanych w laboratoriach diagnostycznych (np. PN-EN ISO/IEC 17025, PN-EN ISO 15189);, Udział w projektach badawczo-rozwojowych finansowanych ze środków krajowych lub UE.

dofinansowanie zajęć sportowych, prywatna opieka medyczna, ubezpieczenie na życie